Manusia tidak berevolusi begitu saja. Kami bercampur.
Selama bertahun-tahun, kita tahu bahwa kita meminjam DNA dari Neanderthal dan Denisovan. Itu sudah menjadi rahasia umum. Orang non-Afrika membawa 1 hingga 2% Neanderthaland Asia dan Oseania memiliki hingga 5% DNA Denisovan. Tapi cerita itu tidak lengkap.
Penelitian baru dari UC Berkeley menunjukkan bahwa kita juga kawin dengan dua garis keturunan “hantu” yang tidak dapat kita lihat. Mereka tidak meninggalkan fosil. Tidak ada tulang. Hanya sinyal diam yang terkubur dalam genom kita.
Satu garis keturunan bercampur dengan Homo sapiens di Afrika lebih dari 50.0000 tahun yang lalu. Yang lainnya berasal dari 1,7 juta tahun yang lalu di Eurasia. Jika digabungkan, mereka menyumbang sekitar 2% dari setiap orang yang hidup saat ini.
Mengapa ini penting? Karena gen-gen kuno ini tidak hanya bertahan untuk gaya saja. Mereka membantu kami bertahan hidup.
Metode TRACE Mengungkapkan Leluhur yang Tersembunyi
Untuk mengetahui hal ini diperlukan alat baru. Para peneliti mengembangkan metode komputasi yang disebut TRACE. Itu singkatan dari TRracking Archaic Contributions via ARG (Ancestral Recombination Graph) Estimation.
Itu tidak melihat DNA kuno dari tulang. Sebaliknya, ia memindai ratusan genom modern. Model ini mencari pola silsilah yang melampaui prediksi model standar.
“Publikasi sebelumnya menunjukkan bahwa mungkin ada nenek moyang hantu… tapi mereka belum menyimpulkan apakah anatomi yang tidak diketahui ini hanya ada di Afrika,” kata penulis utama Yulin Zhang.
Mereka menemukannya. Pada setiap orang.
Tidak hanya di Afrika. Di setiap populasi manusia di Bumi.
Hantu Berusia 800.000 Tahun di Afrika
Silsilah hantu pertama terpisah dari silsilah keluarga kita sekitar 800.700 tahun yang lalu. Itu terjadi sekitar waktu yang sama antara Neanderthal dan Denisovan.
Kelompok ini bercampur dengan manusia modern secara anatomis sebelum kita bermigrasi keluar Afrika. Saat ini, setiap orang membawa 0,5% hingga 1% DNA dari sumber yang tidak diketahui ini.
Ini tersebar luas. Itu halus. Dan itu ada dimana-mana.
Tim memetakan lokasi genom tertentu untuk memastikan bahwa ini bukan kebisingan. Segmen-segmen ini nyata. Dan kemungkinan besar mereka membantu manusia purba beradaptasi dengan tantangan baru.
Warisan Super-Kuno di Eurasia
Silsilah kedua lebih tua. Jauh lebih tua. Sekitar 1,8 juta tahun yang lalu.
Sebut saja kelompok “super-kuno”. Kami belum memiliki urutan DNA mereka. Kami bahkan tidak tahu siapa mereka secara spesifik. Tapi jejak DNA mereka bertahan melalui pintu belakang.
Kelompok kuno ini bercampur dengan Denisovan. Bukan dengan manusia modern secara langsung. Ketika Denisovan kemudian berkembang biak dengan Homo sapiens, mereka membawa serta DNA super-kuno tersebut.
Sinyal ini paling kuat di Oseania. Populasi di wilayah tersebut memiliki tingkat keturunan Denisovan yang sangat tinggi—dan akibatnya sangat kuno.
“Temuan super-kuno ini sangat menarik,” kata Dr. Arjun Biddlanda, seorang postdoc di Johns Hopkins. “Ini mengungkapkan kontribusi genetik dari garis keturunan yang hidup lebih dari satu juta tahun yang lalu.”
Mengapa Tubuh Kita Masih Bergantung pada DNA Kuno
Jadi, apa yang diberikan oleh kerabat kuno ini kepada kita?
Ini bukan hanya sejarah. Itu biologi.
Banyak dari segmen kuno ini berkelompok dalam gen yang terkait dengan kekebalan dan metabolisme. Mereka membantu nenek moyang kita menangani patogen baru. Mencerna makanan yang berbeda. Bertahan di iklim yang lebih dingin.
Ini bukan suatu kebetulan. Seleksi alam mempertahankan apa yang berhasil.
“Varian yang bermanfaat kemudian dapat dipertahankan dan disebarkan ke beberapa generasi,” kata Dr. Priya Moorjani dari UC Berkeley. “Perkawinan silang memperkenalkan variasi genetik baru.”
Intinya, kekuatan hibrida. Atau setidaknya, keberuntungan genetik.
Melampaui Eurasia: Apa yang Kami Hilang
Hingga saat ini, kami hanya memiliki enam genom kuno dengan cakupan tinggi. Semuanya dari Eurasia. Empat Neanderthal. Dua Denisovan.
Afrika adalah ruang kosong. Kerangka waktu yang lebih dalam tidak jelas.
“Jadi, pengetahuan kami… masih belum lengkap,” kata Zhang.
Penelitian ini memperbaiki titik buta tersebut. Namun hal ini juga menimbulkan pertanyaan baru.
Bagaimana jika ada lebih banyak hantu?
Para peneliti berharap dapat menemukan sinyal samar dari garis keturunan lain seiring dengan diversifikasi basis data genom global. Mencontoh lebih banyak umat manusia berarti melihat lebih banyak sejarah.
Menemukan lebih banyak fosil Denisovan juga akan membantu. Urutan protein yang baru-baru ini diekstraksi dari fosil Homo erectus bahkan mungkin dapat membantu kita mengidentifikasi nenek moyang super-kuno.
“Kami menemukan bahwa sekitar 2% genom kami berasal dari hominna purba,” kata Zhang.
Kami tidak murni. Kami tidak tunggal. Kita adalah mosaik. Dan kami baru saja mulai melihat gambaran keseluruhannya.
Memulihkan tanda tangan introgresi hominin kuno menggunakan grafik rekombinasi leluhur oleh Yulin Zhang dkk. diterbitkan 30 Juli 1026 di Sains.
